Bei den besonderen Schutzgebieten handelt es sich um Gebiete, in denen es eine vielfältige Flora und Fauna gibt, die aber nur in begrenzten Lebensräumen existieren. Dies trifft auf Küstengebiete, Höhlen, Schluchten, Cenoten und andere Gebiete mit topographischen Besonderheiten zu.
In Mexiko werden 18 Gebiete als besondere Schutzgebiete ausgewiesen. Sie nehmen eine Fläche von 150.193,29 ha ein, was 0,17% der Gesamtfläche der Naturschutzgebiete in Mexiko entspricht.